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分子蒸馏设备主要包括：分子蒸发器、脱气系统、进料系统、加热系统、冷却真空系统和控制系统。分子蒸馏装置的核心部分是分子蒸发器，其种类主要有3种：
1.离心式：离心力成膜，膜薄，蒸发效率高，但结构复杂，真空密封较难，设备的制造成本高。为提高分离效率，往往需要采用多级串联使用而实现不同物质的多级分离。
2.降膜式：为早期形式，结构简单，但由于液膜厚，效率差，当今世界各国很少采用；
3.刮膜式:形成的液膜薄，分离效率高，但较降膜式结构复杂；
分子蒸馏设备亦称短程蒸馏，它是一项较新的尚未广泛应用于工业化生产的液-液分离技术，其应用能解决大量常规蒸馏技术所不能解决的问题。在高真空状态下，使蒸气分子的平均自由程大于蒸发表面与冷凝表面之间的距离，从而可利用料液中各组分蒸发速率的差异，对液体混合物进行分离。
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